Der Baummarder lebt in den Wäldern und kommt nicht so häufig zu den menschlichen Siedlungen wie der Steinmarder. Der in fast ganz Europa vorkommende Marder lebt im Flachland und im Gebirge bis hinauf an die Baumgrenze. Er kann sich auf den Bäumen außerordentlich gut fortbewegen, Sprünge von drei oder vier Metern sind keine Seltenheit. Tagsüber schläft er in Baumlöchern, in verlassenen Vogelnestern oder Eichhörnchenkobeln. Nachts geht er auf Jagd und stellt Eichhörnchen, Spitzmäusen und Vögeln in ihren Nestern nach. Aber auch Frösche, Insekten, Aas und Früchte wie Nüsse oder Vogelbeeren werden vom Baummarder gerne gefressen. Die Beute wird durch einen Nackenbiss getötet und danach auf einen Baum gezerrt, wo der Marder dann frisst. 
  
Nach der Paarungszeit im Hochsommer, der Ranzzeit, dauert es eine Weile bis das Marderweibchen, die Fähe, die jungen Marder nach acht Monaten Tragezeit im folgenden Frühjahr zur Welt bringt. Die jungen, maximal zehn Zentimeter großen Marder sind Nesthocker und bis zur fünften Lebenswoche blind. Sie bleiben etwa zwei Monate im Nest, das meistens in einem verlassen Kobel eines Eichhörnchens angelegt ist. Die Fähe wird nur alle zwei Jahre für zwei Tage im Sommer paarungswillig. Dann toben die Männchen wild und kreischend durch die Bäume. Die jungen Baummarder werden erst nach zwei Jahren geschlechtsreif. 

Baummarder leben überwiegend als Einzelgänger, sie laufen immer wieder die gleichen Routen ab und markieren diese sogenannten Marderpässe mit einem Duft. Sie jagen in einem Umkreis von bis zu 80 km². Ein Winterschlaf wird nicht abgehalten. Gelegentlich fallen sie einem Greifvogel zur Beute. Durch den Siedlungs- und  Straßenbau des Menschen ist der Marder ebenfalls bedroht.